Der Verein Bergedorfer Mühle e.V. wurde 1995 gegründet und betreut seitdem technisch die Mühle.
Nach dem Eigentümerwechsel 2003 zur Stiftung Denkmalpflege Hamburg hat sich der Verein mit dem neuen Eigentümer auf einen Pachtvertrag nach Erbbaurecht verständigt.
Dies ging nur mit einem neuen Verwendungskonzept, in dem die Ziele klar definiert sind:
1. Die Nutzung der Windmühle in der kulturellen Landschaft Bergedorfs als Denkmal
- Deutscher Mühlentag
- Lange Nacht der Museen
- Tag des offenen Denkmals
- KuLaBe
2. Kulturelle Veranstaltungen wie
- Konzerte (klassisch und Querbeet)
- Kunstausstellung Bergedorf
- Kunstschau Bergedorfer Mühle
- Ostermarkt
- Handwerkermarkt
3. Nutzung der Öffentlichkeit
- Führung von Kleingruppen nach Anmeldung
- Schulen mit dem Thema vom Korn zum Brot
- Mühlensonntag im Sommer mit Schwerpunktthema
- Hochzeit in der Mühle
- Verleihung von Auszeichnungen